More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1046 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  77.56 
 
 		 685 aa  974    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1046  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 675 aa  1350    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1328  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 734 aa  264  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0036093  normal  0.504414 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0429  extracellular solute-binding protein family 5  32.93 
 
 		 726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585941  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.94 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.94 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.94 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.94 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 		 544 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  21.16 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 565 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  21.02 
 
 		 534 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 501 aa  104  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 501 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 		 515 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  24.88 
 
 		 512 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  21.08 
 
 		 520 aa  97.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.12 
 
 		 512 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  24.88 
 
 		 512 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  24.63 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  24.63 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  24.63 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.36 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.36 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  23.36 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 540 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.93 
 
 		 512 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  20.61 
 
 		 509 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 		 528 aa  94.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 512 aa  94  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  23.11 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  23.11 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  22.2 
 
 		 614 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.11 
 
 		 493 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.4 
 
 		 538 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 538 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  23.23 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  22.08 
 
 		 615 aa  90.1  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 		 565 aa  90.5  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 514 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.67 
 
 		 516 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 514 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 		 529 aa  88.2  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 531 aa  87.8  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 531 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 531 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 532 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  22.69 
 
 		 532 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 552 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 617 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.15 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  21.33 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.76 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  22.57 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.89 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  23.93 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 520 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.41 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  23.41 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  23.41 
 
 		 535 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  21.6 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.74 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 550 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  23.92 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>