80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0875 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  52.8 
 
 
810 aa  651    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  89.2 
 
 
788 aa  1218    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
774 aa  1543    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  50.95 
 
 
791 aa  598  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  49.49 
 
 
788 aa  597  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  47.67 
 
 
793 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  51.24 
 
 
779 aa  567  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  51.82 
 
 
787 aa  548  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  45.03 
 
 
781 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 
775 aa  520  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  44.4 
 
 
810 aa  503  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  46.6 
 
 
778 aa  479  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
794 aa  459  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 
790 aa  402  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 
821 aa  371  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
716 aa  111  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 
682 aa  93.2  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
693 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
675 aa  89.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.16 
 
 
607 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 
615 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
560 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
628 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
565 aa  70.5  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
557 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  24.05 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  21.06 
 
 
735 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
627 aa  64.7  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
604 aa  62.4  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
604 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
547 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 
722 aa  59.3  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.27 
 
 
545 aa  58.9  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 
557 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
597 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
584 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 
559 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
604 aa  54.3  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 
557 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
596 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  31.82 
 
 
567 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
636 aa  53.9  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 
503 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 
616 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
557 aa  52.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 
634 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  22.1 
 
 
560 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 
620 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
634 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.77 
 
 
587 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 
606 aa  49.3  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
559 aa  49.3  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 
693 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.5 
 
 
572 aa  49.3  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  25.54 
 
 
729 aa  48.5  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  20 
 
 
577 aa  48.5  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.16 
 
 
578 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
621 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
593 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
587 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  27.36 
 
 
538 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 
553 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 
609 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
528 aa  45.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0082  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 
636 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.5866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 
603 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
544 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
559 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.4 
 
 
551 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
567 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
602 aa  45.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 
579 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
619 aa  45.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.84 
 
 
565 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
518 aa  44.3  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  32.45 
 
 
386 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 
654 aa  44.3  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>