98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0654 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
810 aa  1605    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  44.4 
 
 
774 aa  504  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  44.55 
 
 
788 aa  492  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 
791 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  41.91 
 
 
775 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 
788 aa  478  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  45.23 
 
 
810 aa  477  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  42.84 
 
 
793 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  45.71 
 
 
781 aa  458  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  38.47 
 
 
779 aa  401  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 
778 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 
787 aa  384  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 
794 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 
790 aa  343  7e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  41.85 
 
 
821 aa  297  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  21.8 
 
 
675 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.84 
 
 
607 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
716 aa  70.1  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  19.56 
 
 
735 aa  70.1  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
565 aa  69.3  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
682 aa  65.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
557 aa  64.7  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
557 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
722 aa  62.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
693 aa  63.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 
564 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
596 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
636 aa  59.7  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.78 
 
 
524 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 
615 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.59 
 
 
545 aa  58.9  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 
559 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
559 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.93 
 
 
537 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
604 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 
540 aa  55.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
512 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 
510 aa  55.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
621 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 
517 aa  54.3  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  21.18 
 
 
533 aa  54.3  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
548 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 
547 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
538 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.32 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
539 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  24.31 
 
 
538 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  21.69 
 
 
533 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  20.69 
 
 
569 aa  52.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.41 
 
 
557 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 
627 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
581 aa  52  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.79 
 
 
543 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
500 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 
620 aa  51.2  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 
567 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
579 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
552 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 
557 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
604 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 
531 aa  50.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  23.55 
 
 
514 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 
539 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
502 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 
580 aa  49.3  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 
604 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
603 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 
510 aa  48.9  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 
616 aa  48.9  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 
538 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
538 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.82 
 
 
525 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  20 
 
 
616 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 
501 aa  47.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
564 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 
587 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.16 
 
 
551 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 
548 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  22.52 
 
 
513 aa  47  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
524 aa  47  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  21.62 
 
 
577 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.78 
 
 
520 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.64 
 
 
506 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
557 aa  45.8  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 
507 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
629 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 
567 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
551 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  28.93 
 
 
572 aa  45.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
506 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.45 
 
 
590 aa  45.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 
553 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  21.45 
 
 
592 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
534 aa  44.3  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
512 aa  44.3  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>