70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0552 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  56.69 
 
 		 791 aa  755    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  87.55 
 
 		 793 aa  1202    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  57.06 
 
 		 775 aa  756    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 788 aa  1563    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  52.22 
 
 		 810 aa  692    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  52.78 
 
 		 781 aa  688    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  49.72 
 
 		 788 aa  611  1e-173  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  49.64 
 
 		 774 aa  605  1.0000000000000001e-171  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  51.3 
 
 		 787 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  43.68 
 
 		 779 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 		 810 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 		 778 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  41.53 
 
 		 794 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 790 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 		 821 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 716 aa  112  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.580792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 		 693 aa  98.2  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 682 aa  94.7  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 557 aa  89  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 557 aa  88.2  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.82 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.68 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 675 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 627 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 		 722 aa  63.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  21.04 
 
 		 564 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 560 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 559 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 524 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 604 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  35.44 
 
 		 560 aa  51.2  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 604 aa  50.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 606 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 		 579 aa  50.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.3 
 
 		 556 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  34.18 
 
 		 560 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 597 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 587 aa  48.9  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  22.94 
 
 		 609 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.6 
 
 		 587 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 544 aa  47.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 531 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 		 548 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  21.67 
 
 		 577 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 552 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 603 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 636 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 548 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 553 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 		 529 aa  45.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  24.81 
 
 		 590 aa  45.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 604 aa  44.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 591 aa  44.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 521 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 579 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 540 aa  44.3  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>