232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0482 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
693 aa  1373    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
682 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
716 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
794 aa  102  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
735 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
616 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.89 
 
 
607 aa  99  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
788 aa  98.6  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  24.96 
 
 
775 aa  94.7  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 
615 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
774 aa  90.1  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
788 aa  89  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
787 aa  88.2  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
779 aa  87  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 
810 aa  84.3  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
781 aa  81.6  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
821 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
793 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.76 
 
 
564 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  20.92 
 
 
587 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
778 aa  78.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 
675 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  21.87 
 
 
621 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
791 aa  70.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 
790 aa  68.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 
629 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30 
 
 
524 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
526 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
810 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
547 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.22 
 
 
581 aa  64.7  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.65 
 
 
587 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  20.34 
 
 
552 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  20.34 
 
 
552 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
555 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
542 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 
528 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.04 
 
 
596 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  20.57 
 
 
603 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 
535 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
545 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
525 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
547 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  21.71 
 
 
616 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 
528 aa  62.4  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 
536 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 
587 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  21.38 
 
 
555 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  23.64 
 
 
527 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.75 
 
 
531 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  21.31 
 
 
533 aa  58.9  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 
604 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
552 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.69 
 
 
615 aa  58.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.02 
 
 
550 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.92 
 
 
616 aa  57.8  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 
589 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
591 aa  57.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
544 aa  57.4  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
523 aa  57.4  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.76 
 
 
532 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
1437 aa  56.6  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  23.98 
 
 
562 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
518 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  24.8 
 
 
532 aa  56.6  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
563 aa  56.2  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.46 
 
 
532 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
534 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.53 
 
 
592 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  22.69 
 
 
524 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  21.2 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
546 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 
594 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 
616 aa  55.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.43 
 
 
531 aa  55.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 
531 aa  54.7  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 
564 aa  54.7  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.72 
 
 
534 aa  54.3  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  20.13 
 
 
536 aa  53.9  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  20.99 
 
 
622 aa  53.5  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  21.79 
 
 
592 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 
584 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  25.21 
 
 
544 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 
590 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  22.73 
 
 
538 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 
604 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
544 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3376  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
552 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
579 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
593 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 
609 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 
530 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.86 
 
 
529 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 
522 aa  52  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
558 aa  52  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
561 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>