More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1168 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 606 aa  1233    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  70.84 
 
 		 607 aa  921    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 1437 aa  178  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 557 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.14 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 534 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 576 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  21.58 
 
 		 532 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.95 
 
 		 542 aa  97.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 551 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.47 
 
 		 546 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 579 aa  95.1  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 533 aa  95.5  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 539 aa  94.7  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 508 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 529 aa  94  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 552 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  24.01 
 
 		 562 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 		 509 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  20.98 
 
 		 540 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 		 541 aa  87.8  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 578 aa  87.4  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  21.73 
 
 		 565 aa  87.4  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 525 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 525 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.67 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  20.68 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  22.31 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.3 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.3 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 600 aa  80.5  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 535 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  23.88 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  22.02 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  21.98 
 
 		 664 aa  77.4  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 575 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  24.12 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.45 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.91 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  22.5 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  23.1 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.72 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.72 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 557 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_002620  TC0765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.72 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.345904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  20.56 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.37 
 
 		 631 aa  74.3  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.62 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  21.17 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.75 
 
 		 587 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 		 516 aa  73.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 		 529 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 557 aa  73.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.62 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.16 
 
 		 592 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  22.18 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.66 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.75 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  21.6 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>