64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1274 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  55.9 
 
 
790 aa  709    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  62.95 
 
 
821 aa  781    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
794 aa  1586    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 
810 aa  493  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  42.88 
 
 
787 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  45.75 
 
 
774 aa  462  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 
788 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  42.5 
 
 
788 aa  452  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 
793 aa  435  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 
779 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
775 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 
791 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 
778 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
781 aa  391  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 
810 aa  368  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
716 aa  105  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  29.34 
 
 
693 aa  99.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
682 aa  89  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.82 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  21.52 
 
 
735 aa  71.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  34.01 
 
 
615 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
722 aa  65.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 
627 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 
565 aa  59.3  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
628 aa  58.9  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
597 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
557 aa  56.6  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
611 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  21.47 
 
 
604 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  20.98 
 
 
604 aa  55.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 
579 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.31 
 
 
545 aa  54.3  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
581 aa  53.9  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
559 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  20.55 
 
 
564 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 
502 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 
675 aa  50.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 
557 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
903 aa  48.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 
604 aa  47.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  22.09 
 
 
547 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
621 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.07 
 
 
638 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.82 
 
 
525 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
525 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.3 
 
 
615 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 
580 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 
580 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 
525 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  21.86 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  21.53 
 
 
567 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.5 
 
 
525 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
626 aa  46.2  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  38.03 
 
 
620 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 
535 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
616 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
654 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
596 aa  45.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 
539 aa  45.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  22.6 
 
 
525 aa  44.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.27 
 
 
534 aa  44.3  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  28.19 
 
 
551 aa  44.3  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>