More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0901 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
675 aa  1387    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  42.93 
 
 
616 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 
592 aa  258  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 
596 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
616 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 
627 aa  161  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.12 
 
 
607 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
587 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  23.63 
 
 
621 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  24.17 
 
 
572 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
735 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
560 aa  106  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
557 aa  105  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
559 aa  105  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
557 aa  105  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
559 aa  104  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
615 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
531 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  22.28 
 
 
562 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
554 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 
765 aa  97.8  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 
557 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
540 aa  96.3  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 
562 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
597 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
682 aa  94.7  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 
580 aa  94.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
609 aa  94.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.61 
 
 
609 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
547 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
788 aa  91.7  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.2 
 
 
551 aa  90.5  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  23.79 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
774 aa  90.1  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 
564 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.3 
 
 
545 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 
603 aa  88.2  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
548 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
775 aa  87.4  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.84 
 
 
516 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
595 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 
628 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 
567 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
512 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
791 aa  84.7  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
636 aa  84.7  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.45 
 
 
526 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
510 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 
584 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 
522 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
631 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
561 aa  83.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.99 
 
 
556 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.17 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
578 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 
810 aa  82  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
604 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  23.48 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
781 aa  80.9  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.19 
 
 
564 aa  80.5  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
535 aa  80.5  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 
537 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
779 aa  80.5  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 
604 aa  80.5  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  21.89 
 
 
560 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.94 
 
 
563 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
576 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  23.48 
 
 
560 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
520 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.49 
 
 
563 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 
587 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 
693 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
528 aa  77  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24 
 
 
505 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
693 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.27 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
521 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 
604 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  21.39 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 
735 aa  74.7  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.22 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
655 aa  74.3  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.22 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>