100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1305 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
693 aa  1427    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  62.07 
 
 
603 aa  823    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
587 aa  280  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 
621 aa  279  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 
735 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 
628 aa  188  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 
564 aa  130  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.52 
 
 
607 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
615 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
616 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
616 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
627 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
675 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 
604 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
597 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
565 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
531 aa  66.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.14 
 
 
551 aa  66.6  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  22.1 
 
 
604 aa  65.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
560 aa  64.3  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
569 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.75 
 
 
596 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  21.87 
 
 
601 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.84 
 
 
564 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
604 aa  62  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
567 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.38 
 
 
547 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
567 aa  60.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
568 aa  60.1  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  21.2 
 
 
604 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
604 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.27 
 
 
545 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  20.74 
 
 
567 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 
562 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.92 
 
 
609 aa  56.6  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  22.19 
 
 
548 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  22.36 
 
 
557 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 
554 aa  55.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 
551 aa  55.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 
534 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
559 aa  54.3  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 
567 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 
548 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.35 
 
 
560 aa  53.5  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.07 
 
 
535 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  22.25 
 
 
503 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  40.22 
 
 
617 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 
545 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 
503 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 
542 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.35 
 
 
525 aa  48.9  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  22.44 
 
 
579 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
544 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
560 aa  48.9  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.48 
 
 
557 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  24.91 
 
 
529 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 
774 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
775 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2811  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
540 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490323  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  21.17 
 
 
574 aa  48.5  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  23.53 
 
 
560 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  28.35 
 
 
729 aa  47.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
506 aa  47.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
781 aa  47.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 
561 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.19 
 
 
563 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.59 
 
 
552 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  21.76 
 
 
555 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
506 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 
529 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 
576 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
573 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  26.14 
 
 
605 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  22.73 
 
 
541 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 
846 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
526 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  23.1 
 
 
525 aa  45.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.93 
 
 
511 aa  45.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 
631 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  21.13 
 
 
572 aa  45.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  20.3 
 
 
546 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.99 
 
 
542 aa  45.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
526 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
791 aa  44.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
793 aa  44.7  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
601 aa  44.3  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.37 
 
 
556 aa  44.3  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
512 aa  43.9  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  22.81 
 
 
504 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 
547 aa  43.9  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  20.15 
 
 
533 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 
508 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
579 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 
536 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 
551 aa  43.9  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>