188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0685 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
682 aa  1373    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  58.2 
 
 
716 aa  674    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
693 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
790 aa  94.7  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
775 aa  94.7  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
788 aa  94.4  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
675 aa  94  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
793 aa  94  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
774 aa  93.2  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
810 aa  91.7  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
794 aa  90.1  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
788 aa  89  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
615 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
821 aa  88.2  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
787 aa  87.4  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
779 aa  81.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 
616 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
791 aa  74.7  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  27.46 
 
 
568 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
592 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.24 
 
 
520 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.36 
 
 
525 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 
565 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
567 aa  62.4  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.19 
 
 
562 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.24 
 
 
579 aa  61.6  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.16 
 
 
545 aa  61.2  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.65 
 
 
679 aa  61.2  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 
587 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.38 
 
 
607 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
557 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 
627 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
557 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
531 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 
631 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
781 aa  59.3  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.91 
 
 
556 aa  57.4  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
555 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25 
 
 
560 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.29 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 
528 aa  56.6  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  25.09 
 
 
560 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.14 
 
 
511 aa  55.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 
531 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 
629 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
604 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.22 
 
 
543 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  23.3 
 
 
604 aa  53.9  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 
722 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  25.75 
 
 
729 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
543 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.51 
 
 
510 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 
596 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
625 aa  53.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 
604 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 
617 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
654 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
544 aa  52.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
580 aa  52.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 
524 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
539 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
529 aa  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
540 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.17 
 
 
524 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.74 
 
 
567 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
554 aa  52  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.35 
 
 
542 aa  52  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 
604 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.7 
 
 
511 aa  51.6  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
625 aa  51.6  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
519 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.54 
 
 
511 aa  51.2  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  21.48 
 
 
616 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
591 aa  50.8  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 
518 aa  50.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.06 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.3 
 
 
587 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
525 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  21.97 
 
 
495 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
735 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.82 
 
 
539 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 
609 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
616 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
549 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 
516 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
580 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 
515 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  25.13 
 
 
542 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 
535 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.17 
 
 
511 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
544 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
543 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.87 
 
 
540 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
587 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.2 
 
 
542 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>