54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1424 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
779 aa  1558    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  49.75 
 
 
778 aa  599  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  47.57 
 
 
774 aa  569  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 
810 aa  567  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  46.04 
 
 
788 aa  558  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 
791 aa  525  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 
788 aa  486  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  40.25 
 
 
775 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 
793 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 
781 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 
787 aa  450  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  38.45 
 
 
794 aa  412  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
810 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 
790 aa  401  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 
821 aa  365  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
693 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
716 aa  83.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
682 aa  80.9  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
675 aa  78.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
557 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
557 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
615 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 
565 aa  57.8  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 
629 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  21.03 
 
 
735 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 
722 aa  57  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 
627 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.28 
 
 
569 aa  55.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
604 aa  54.7  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.08 
 
 
554 aa  54.3  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.48 
 
 
547 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.34 
 
 
607 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 
557 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
593 aa  52.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
604 aa  52.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.64 
 
 
587 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
626 aa  48.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
580 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  24.11 
 
 
604 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 
537 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
560 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 
616 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  22.54 
 
 
567 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  19.8 
 
 
539 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  21.57 
 
 
534 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 
596 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  21.62 
 
 
564 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
525 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
580 aa  45.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  22 
 
 
581 aa  45.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 
634 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  35.8 
 
 
634 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
559 aa  44.3  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>