244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4449 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  83.28 
 
 
604 aa  1073    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  78.15 
 
 
604 aa  1025    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
604 aa  1256    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
567 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
589 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 
564 aa  104  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 
601 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
621 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 
735 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 
532 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  21.81 
 
 
603 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 
675 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  21.96 
 
 
693 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  20.96 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 
559 aa  70.5  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3340  4-phytase  24.25 
 
 
608 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
592 aa  67  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.47 
 
 
593 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
580 aa  66.6  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 
557 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.26 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.04 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.04 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.04 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.83 
 
 
593 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
559 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
507 aa  65.1  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
615 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 
530 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  21.59 
 
 
527 aa  63.9  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  22.97 
 
 
596 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 
522 aa  62  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
568 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 
693 aa  61.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
788 aa  60.8  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
774 aa  60.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
591 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
597 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
591 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  21.29 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
551 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.52 
 
 
528 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  20.79 
 
 
541 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.36 
 
 
537 aa  58.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  21.56 
 
 
572 aa  58.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  22.88 
 
 
567 aa  57.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 
506 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
530 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.91 
 
 
607 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.4 
 
 
506 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  22.99 
 
 
540 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.13 
 
 
545 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
526 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 
540 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 
794 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  21.23 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  21.73 
 
 
615 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 
532 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 
604 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 
523 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
810 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 
810 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.07 
 
 
521 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
538 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
606 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.05 
 
 
615 aa  54.3  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
512 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.36 
 
 
504 aa  54.3  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 
544 aa  54.3  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.05 
 
 
616 aa  53.9  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
682 aa  53.9  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.58 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  20.55 
 
 
627 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.43 
 
 
525 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  21.64 
 
 
517 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 
528 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 
604 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  21.56 
 
 
519 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 
562 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.67 
 
 
592 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 
516 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  27.4 
 
 
511 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0655  ABC peptide transporter  23.19 
 
 
633 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  22.17 
 
 
559 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 
560 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  22.71 
 
 
518 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  21.37 
 
 
542 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
788 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
787 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  22.51 
 
 
540 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  21 
 
 
511 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  21.35 
 
 
631 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.69 
 
 
579 aa  51.6  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>