113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1411 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  53.97 
 
 		 781 aa  695    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  55.54 
 
 		 810 aa  722    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  58.05 
 
 		 788 aa  756    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  54.27 
 
 		 775 aa  700    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  56.5 
 
 		 793 aa  736    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  53.42 
 
 		 788 aa  656    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 791 aa  1562    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  50.66 
 
 		 774 aa  605  1.0000000000000001e-171  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  48.33 
 
 		 787 aa  560  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  45.81 
 
 		 779 aa  527  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 778 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  42.9 
 
 		 810 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 		 790 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 794 aa  399  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 821 aa  342  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 675 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 716 aa  77.8  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.64 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 682 aa  73.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  21.62 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 693 aa  68.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 560 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 591 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 		 548 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  20.98 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  22.14 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 636 aa  56.2  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 512 aa  55.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.48 
 
 		 587 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 587 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  24.87 
 
 		 580 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 553 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 579 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  21.35 
 
 		 735 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.25 
 
 		 568 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  20.37 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.02 
 
 		 520 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 551 aa  52.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 		 557 aa  52.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.53 
 
 		 520 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  23.44 
 
 		 547 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.09 
 
 		 572 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 520 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  22.99 
 
 		 547 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 547 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  22.28 
 
 		 555 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.3 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.99 
 
 		 547 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.3 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.3 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.3 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 521 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  22.99 
 
 		 547 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.75 
 
 		 547 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 547 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.75 
 
 		 547 aa  48.9  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.07 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 514 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.9 
 
 		 493 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.9 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.07 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  20.63 
 
 		 616 aa  48.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.9 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.07 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.07 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.07 
 
 		 512 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 		 565 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 512 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 581 aa  47.8  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.6 
 
 		 520 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 516 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 544 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 520 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  22.81 
 
 		 557 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 603 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 518 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 606 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  22.02 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>