82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1494 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
716 aa  1428    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  58.17 
 
 
682 aa  679    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 
693 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
788 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
774 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
788 aa  104  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
794 aa  104  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
810 aa  95.9  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
787 aa  94  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
821 aa  87.4  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
790 aa  87.8  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
779 aa  84.7  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
791 aa  80.1  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
793 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
615 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
562 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
781 aa  69.7  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.7 
 
 
607 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
592 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
552 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
775 aa  61.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
565 aa  60.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
557 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
557 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.94 
 
 
510 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
554 aa  58.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  21.99 
 
 
567 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
778 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  22.42 
 
 
562 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.29 
 
 
524 aa  54.3  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.46 
 
 
511 aa  53.9  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
627 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  19.08 
 
 
551 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 
604 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.24 
 
 
545 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  24.9 
 
 
560 aa  50.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.67 
 
 
511 aa  50.8  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.7 
 
 
542 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
604 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 
540 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 
564 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 
621 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  37.04 
 
 
685 aa  48.5  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
551 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
625 aa  47.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 
502 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.83 
 
 
543 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
604 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.4 
 
 
587 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
550 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
543 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.09 
 
 
524 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2119  hypothetical protein  22.34 
 
 
729 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.26 
 
 
525 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  25.32 
 
 
560 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
587 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
625 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  21.52 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
525 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 
531 aa  45.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  20.68 
 
 
511 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.72 
 
 
542 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.64 
 
 
556 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 
514 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.6 
 
 
563 aa  45.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.23 
 
 
534 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25 
 
 
550 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
531 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
525 aa  45.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
597 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 
605 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.82 
 
 
539 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 
547 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29.91 
 
 
504 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  21.69 
 
 
529 aa  44.3  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.97 
 
 
498 aa  43.9  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.21 
 
 
525 aa  43.9  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>