43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0600 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  57.31 
 
 		 821 aa  724    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  55.87 
 
 		 794 aa  707    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 790 aa  1574    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 		 810 aa  429  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 781 aa  422  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 778 aa  418  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 788 aa  411  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 		 788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 		 774 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 779 aa  402  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 793 aa  396  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 791 aa  397  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 775 aa  362  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 682 aa  94.7  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 716 aa  87.8  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  33.5 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 722 aa  73.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 		 735 aa  71.6  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.99 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 557 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 		 693 aa  68.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 559 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 675 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 616 aa  49.7  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  19.76 
 
 		 604 aa  48.5  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 564 aa  48.5  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.62 
 
 		 525 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 560 aa  47.8  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 		 567 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 539 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0753  extracellular solute-binding protein family 5  34.55 
 
 		 685 aa  46.6  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.371532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 579 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2171  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 546 aa  45.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 628 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 604 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  23.49 
 
 		 895 aa  44.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  34.15 
 
 		 551 aa  44.3  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>