76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1189 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 
781 aa  683    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  52.55 
 
 
810 aa  699    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  87.55 
 
 
788 aa  1223    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  56.69 
 
 
791 aa  758    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
793 aa  1581    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  54.64 
 
 
775 aa  716    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  48.37 
 
 
788 aa  600  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  48.8 
 
 
774 aa  599  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  49.14 
 
 
787 aa  595  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 
779 aa  489  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 
810 aa  482  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 
778 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  39.97 
 
 
794 aa  444  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 
790 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  39.12 
 
 
821 aa  363  8e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
716 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
682 aa  98.6  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
693 aa  88.2  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 
675 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
557 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 
569 aa  78.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.94 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  21.33 
 
 
621 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
554 aa  73.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  22.89 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  22.63 
 
 
592 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
560 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  22.52 
 
 
627 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.85 
 
 
545 aa  65.1  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 
579 aa  60.1  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
560 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  22.03 
 
 
735 aa  60.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
722 aa  58.9  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
628 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  21.65 
 
 
564 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
547 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
615 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  22.51 
 
 
560 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 
553 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.73 
 
 
524 aa  55.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  22.83 
 
 
577 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
606 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 
548 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
616 aa  50.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 
540 aa  50.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
548 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.15 
 
 
556 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 
529 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
579 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  22.68 
 
 
560 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
581 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  20.29 
 
 
587 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
559 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25 
 
 
638 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
551 aa  48.5  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 
565 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
559 aa  47.8  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
544 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 
534 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
595 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 
567 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 
537 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
596 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
604 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
531 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
584 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 
604 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
590 aa  45.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
603 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  20.29 
 
 
544 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 
562 aa  44.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
634 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.39 
 
 
565 aa  44.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
693 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>