More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2233 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 735 aa  1472    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.55 
 
 		 621 aa  256  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  31.08 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 603 aa  220  7.999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 693 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 628 aa  149  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.39 
 
 		 607 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 616 aa  124  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 627 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 557 aa  110  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 675 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 567 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 559 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 693 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 616 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 615 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 567 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 597 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.55 
 
 		 545 aa  88.2  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 604 aa  80.9  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 810 aa  80.1  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  22.42 
 
 		 596 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 560 aa  72  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 510 aa  72  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.67 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  23.74 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 512 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 562 aa  70.5  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.42 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.68 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  20.22 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 568 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  21.06 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.01 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 548 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 544 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 631 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  22.29 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  20.63 
 
 		 775 aa  62  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  24.84 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3887  extracellular solute-binding protein family 5  20.78 
 
 		 601 aa  61.6  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.544175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.77 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.32 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  24.77 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3888  extracellular solute-binding protein family 5  21.14 
 
 		 589 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.170596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.64 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 788 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  20.55 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.16 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  21.92 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>