122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1161 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  57.25 
 
 		 781 aa  742    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  57.82 
 
 		 788 aa  750    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 775 aa  1540    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 		 793 aa  692    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  54.06 
 
 		 791 aa  698    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  48.73 
 
 		 810 aa  601  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  44.82 
 
 		 774 aa  524  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  44.29 
 
 		 788 aa  522  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  41.94 
 
 		 810 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  43.83 
 
 		 779 aa  478  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  39.86 
 
 		 778 aa  461  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 794 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 		 790 aa  365  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 821 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 693 aa  93.2  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 675 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 682 aa  77.4  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  36 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  22.44 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.6 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 569 aa  63.9  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  21.04 
 
 		 627 aa  62  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  20.57 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.56 
 
 		 545 aa  55.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 		 579 aa  55.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  21.94 
 
 		 621 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 537 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  24.58 
 
 		 577 aa  54.7  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 591 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.42 
 
 		 512 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.42 
 
 		 512 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.42 
 
 		 512 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.96 
 
 		 493 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 		 564 aa  54.3  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 616 aa  54.3  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  54.3  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 520 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 551 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.96 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.96 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 560 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.24 
 
 		 520 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  35 
 
 		 532 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 603 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 592 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1142  extracellular solute-binding protein family 5  20.59 
 
 		 616 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 567 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 512 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 532 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 547 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 636 aa  50.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 626 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 559 aa  50.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  24.06 
 
 		 568 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  21.61 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25.38 
 
 		 510 aa  49.3  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 604 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  22.73 
 
 		 587 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.12 
 
 		 556 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 591 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 693 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0062  ABC nickel transporter, periplasmic ligand binding protein  22.28 
 
 		 511 aa  48.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 		 579 aa  48.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 544 aa  47.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 604 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  34.12 
 
 		 560 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 531 aa  47.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 548 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  32.89 
 
 		 620 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 576 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 		 529 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 548 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.15 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  21.1 
 
 		 590 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 502 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 591 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 521 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 539 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  32.94 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  25.25 
 
 		 862 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1615  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 596 aa  45.8  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.2 
 
 		 638 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>