More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2600 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
500 aa  1038    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 
543 aa  1041    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
532 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.57 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  39.57 
 
 
547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 
591 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  33.87 
 
 
579 aa  265  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
568 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
593 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  28.65 
 
 
610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 
612 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 
608 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
600 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
599 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.25 
 
 
540 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
575 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
617 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.33 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
575 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
567 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.49 
 
 
567 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.9 
 
 
566 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.44 
 
 
575 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.23 
 
 
575 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.64 
 
 
575 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.94 
 
 
575 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
601 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 
555 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 
559 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
610 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.53 
 
 
575 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.06 
 
 
575 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.73 
 
 
538 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 
593 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
551 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 
593 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 
593 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.89 
 
 
593 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 
593 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.71 
 
 
593 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26.27 
 
 
518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
540 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 
576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
593 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.81 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
538 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.68 
 
 
592 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
580 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 
554 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
565 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.38 
 
 
556 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  26.23 
 
 
587 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
643 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
593 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
591 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 
522 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
594 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  26.93 
 
 
548 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 
557 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 
527 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
528 aa  99.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
548 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 
528 aa  97.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
531 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
517 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 
566 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.84 
 
 
536 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
564 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 
591 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
631 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  24.64 
 
 
562 aa  95.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.98 
 
 
539 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
526 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.71 
 
 
511 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 
547 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
639 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
524 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
555 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.49 
 
 
531 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.51 
 
 
536 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.71 
 
 
580 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  24.71 
 
 
579 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  24.75 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.4 
 
 
511 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 
536 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
617 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.71 
 
 
536 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
581 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 
638 aa  91.3  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>