238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1141 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 612 aa  1246    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  82.89 
 
 		 608 aa  1026    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  60.67 
 
 		 610 aa  716    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  44.39 
 
 		 610 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 601 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  35.74 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 600 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 		 599 aa  357  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 643 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 		 591 aa  220  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  31.27 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 593 aa  200  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 		 568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.92 
 
 		 543 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  28.46 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 547 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.48 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.78 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.78 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  22.08 
 
 		 607 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.71 
 
 		 534 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 577 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  21.32 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 577 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  23.6 
 
 		 518 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  21.91 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  21.36 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.84 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 517 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 532 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.68 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  20.39 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  20.42 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.2 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  22.42 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.59 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.42 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.26 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.59 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.26 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.26 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2800  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.09 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  22.04 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  22.55 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 		 578 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.63 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.24 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 575 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 534 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.63 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  24.63 
 
 		 543 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 607 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 500 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1093  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 629 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0361636  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  22.08 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.28 
 
 		 566 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.04 
 
 		 594 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.01 
 
 		 567 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  20.81 
 
 		 591 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 618 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 595 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  23.01 
 
 		 524 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  21.05 
 
 		 578 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 594 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0188  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 547 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.59 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  22.6 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  20.89 
 
 		 545 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 508 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  22.76 
 
 		 502 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 567 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  19.49 
 
 		 540 aa  51.6  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.01 
 
 		 575 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  23.14 
 
 		 552 aa  51.2  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 		 550 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 544 aa  51.2  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 526 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.29 
 
 		 535 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 572 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  20.75 
 
 		 587 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  23.66 
 
 		 516 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>