More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2605 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 
498 aa  1035    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
547 aa  1130    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  41.68 
 
 
532 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.4 
 
 
543 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  39.57 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
591 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
579 aa  223  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 
568 aa  190  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  27.26 
 
 
593 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
599 aa  153  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
600 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.56 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 
608 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
565 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
610 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.51 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
539 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.78 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 
617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
534 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
533 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
538 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
534 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.62 
 
 
520 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.19 
 
 
542 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.44 
 
 
531 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
575 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
587 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 
532 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  22.96 
 
 
574 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.51 
 
 
575 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 
575 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 
622 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
551 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.37 
 
 
575 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.05 
 
 
532 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
601 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
532 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
575 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.06 
 
 
524 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.09 
 
 
539 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  20.79 
 
 
557 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 
572 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
591 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.32 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.35 
 
 
527 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.27 
 
 
534 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.48 
 
 
534 aa  99.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0409  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.83 
 
 
527 aa  98.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0352  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.83 
 
 
527 aa  98.6  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 
501 aa  97.8  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 
618 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
526 aa  97.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.92 
 
 
531 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  24.09 
 
 
587 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.01 
 
 
524 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
547 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 
549 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  26.7 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
544 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
531 aa  94.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25 
 
 
556 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 
562 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
629 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
544 aa  90.9  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.35 
 
 
568 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.89 
 
 
542 aa  89.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
579 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  25.84 
 
 
535 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.84 
 
 
535 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  25.84 
 
 
535 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  23.65 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
593 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  22.42 
 
 
566 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
569 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
578 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
575 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  23.33 
 
 
535 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
638 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
559 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.82 
 
 
555 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 
594 aa  87.8  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.67 
 
 
567 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 
533 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 
584 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
529 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.26 
 
 
495 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  21.44 
 
 
563 aa  87  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 
643 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  25.78 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>