43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8321 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 643 aa  1312    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 617 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 601 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  33.97 
 
 		 608 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  33.28 
 
 		 612 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 610 aa  261  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  31.99 
 
 		 610 aa  229  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 568 aa  143  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 593 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 591 aa  125  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.35 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 547 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.51 
 
 		 498 aa  87  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.32 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.32 
 
 		 529 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.56 
 
 		 542 aa  52  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  21.24 
 
 		 607 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.16 
 
 		 543 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  21.16 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.78 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 591 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0866  twin-arginine translocation pathway signal  20.9 
 
 		 573 aa  47.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  21.9 
 
 		 607 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 595 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 530 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.78 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.78 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.78 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 552 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  21.18 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0979  ABC transporter, substrate-binding protein  25.13 
 
 		 553 aa  44.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  20.99 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4132  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 		 610 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 550 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  22.32 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.59 
 
 		 600 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>