125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2666 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2666  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 617 aa  1274    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2145  extracellular solute-binding protein  77.13 
 
 		 601 aa  930    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377347  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1141  extracellular solute-binding protein family 5  35.74 
 
 		 612 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.121856  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1144  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 		 608 aa  363  4e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.471002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1520  extracellular solute-binding protein family 5  35.36 
 
 		 610 aa  357  5e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8321  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 643 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.860873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4778  extracellular solute-binding protein  33.39 
 
 		 600 aa  287  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4336  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168516  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0886  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 		 610 aa  260  4e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2261  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 579 aa  163  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0252536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2492  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 568 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000108616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 593 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.32 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 500 aa  144  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 532 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2605  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2992  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.33 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.022499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.82 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.64 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  21.95 
 
 		 520 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 526 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 512 aa  55.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 532 aa  53.9  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 		 622 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  23.72 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.75 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 		 517 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  23.03 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 591 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 540 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 544 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  21.65 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  23.1 
 
 		 602 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.53 
 
 		 540 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 538 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 578 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.13 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  23.1 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.28 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.68 
 
 		 538 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 536 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 520 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 520 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  21.77 
 
 		 512 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 		 547 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  21.77 
 
 		 512 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  22.74 
 
 		 587 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.08 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.47 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 541 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  21.51 
 
 		 512 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  21.51 
 
 		 512 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  21.51 
 
 		 512 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.38 
 
 		 547 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  22.41 
 
 		 619 aa  47.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 		 584 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  21.1 
 
 		 535 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.19 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.02 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  21.56 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  21.13 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  27.66 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  28.19 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  28.19 
 
 		 559 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 592 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  22.69 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 520 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  27.27 
 
 		 575 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.73 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.19 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.63 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 512 aa  45.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 643 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.6 
 
 		 512 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.6 
 
 		 512 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  25 
 
 		 510 aa  45.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.6 
 
 		 512 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>