More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2827 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  58.06 
 
 		 592 aa  680    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 592 aa  1202    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  38.73 
 
 		 635 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  35.59 
 
 		 618 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 611 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  32.48 
 
 		 606 aa  300  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 		 606 aa  299  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  33.55 
 
 		 600 aa  291  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  35.26 
 
 		 581 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  32.62 
 
 		 619 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 604 aa  183  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 597 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 554 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.05 
 
 		 591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 563 aa  123  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.35 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  24.79 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24.84 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 541 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 548 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  23.62 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  23.96 
 
 		 585 aa  97.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.01 
 
 		 578 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.3 
 
 		 542 aa  93.6  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 567 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  21.98 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.57 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.94 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.94 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.04 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 639 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.94 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.94 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.3 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  22.5 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  22.18 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.39 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  23.28 
 
 		 605 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  22.8 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.66 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.45 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  23.72 
 
 		 610 aa  77  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  23.21 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  22.28 
 
 		 568 aa  74.7  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  22.47 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 533 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 		 622 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 617 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.01 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 		 590 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 545 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  22.44 
 
 		 569 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  22.15 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.73 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 614 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  21.4 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  22.31 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3294  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  25.42 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.3 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  21.68 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>