15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0915 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  100 
 
 
386 aa  775    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  82.56 
 
 
390 aa  657    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  83.16 
 
 
386 aa  620  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  78.11 
 
 
379 aa  596  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 
994 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 
1006 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  36.54 
 
 
1000 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 
1162 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  27.49 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  23.8 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  26.84 
 
 
663 aa  56.2  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  24.39 
 
 
1042 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  38.16 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  38.16 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  36.84 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>