62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1616 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 663 aa  1345    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  50.12 
 
 		 1162 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  58.3 
 
 		 674 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  57.87 
 
 		 674 aa  270  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  52.49 
 
 		 648 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  27.09 
 
 		 1042 aa  127  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  33.19 
 
 		 313 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 1006 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 994 aa  97.1  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 1000 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  44.33 
 
 		 426 aa  83.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  32.61 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  43.9 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  28.34 
 
 		 1255 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.75 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.75 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.13 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  45.12 
 
 		 1013 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  41.38 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  26.27 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.08 
 
 		 1117 aa  67.8  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  54.1 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  43.75 
 
 		 84 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  34.19 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.1 
 
 		 131 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.42 
 
 		 814 aa  61.2  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  38.96 
 
 		 98 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33884  predicted protein  44.29 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.025698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3879  hypothetical protein  41.11 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0769157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.63 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3795  hypothetical protein  41.11 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  30.97 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  35.63 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  27.75 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.52 
 
 		 196 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  30.97 
 
 		 267 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  26.84 
 
 		 386 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  30.97 
 
 		 267 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  26.67 
 
 		 390 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  41.3 
 
 		 715 aa  54.3  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3738  hypothetical protein  41.25 
 
 		 121 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.515742  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  24.9 
 
 		 379 aa  53.9  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.6 
 
 		 838 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  26.7 
 
 		 249 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  33.33 
 
 		 762 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  30.77 
 
 		 102 aa  51.6  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.42 
 
 		 101 aa  51.2  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 102 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  42.37 
 
 		 102 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  35.82 
 
 		 560 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  39.24 
 
 		 593 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.19 
 
 		 900 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.05 
 
 		 104 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.4 
 
 		 98 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  35.63 
 
 		 663 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12690  hypothetical protein  26.24 
 
 		 180 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  26.29 
 
 		 1472 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  38.96 
 
 		 101 aa  44.3  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  32.56 
 
 		 98 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>