37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0639 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 400 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2452  hypothetical protein  30.1 
 
 		 226 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0483  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.542096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0413  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  34.88 
 
 		 663 aa  59.7  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1162 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  31.46 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  33.33 
 
 		 674 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  32.14 
 
 		 674 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.24 
 
 		 206 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.04 
 
 		 92 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  35.71 
 
 		 648 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.24 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  33.87 
 
 		 102 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  40.82 
 
 		 715 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.71 
 
 		 131 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.67 
 
 		 97 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  33.87 
 
 		 102 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  34.38 
 
 		 555 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  30.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  25 
 
 		 196 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  35.8 
 
 		 736 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.92 
 
 		 623 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  35.8 
 
 		 736 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  27.78 
 
 		 119 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  39.06 
 
 		 741 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  31.94 
 
 		 101 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  26.92 
 
 		 223 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.33 
 
 		 1117 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  46.94 
 
 		 737 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  46.94 
 
 		 736 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  39.34 
 
 		 741 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  31.75 
 
 		 749 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  42.31 
 
 		 736 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  42.31 
 
 		 736 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  42.31 
 
 		 736 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>