39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2682 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  100 
 
 		 102 aa  214  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  59.8 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  57.69 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.94 
 
 		 102 aa  116  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  52.94 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 102 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  50.98 
 
 		 100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  46.08 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  50 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.06 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.51 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  48.54 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  40 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.11 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  48.28 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.57 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  39.08 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.53 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.53 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  40.4 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.38 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.24 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  44.59 
 
 		 648 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.18 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  35.82 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  38.71 
 
 		 793 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  40.32 
 
 		 674 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  38.71 
 
 		 674 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  30.67 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  35.06 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 		 400 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 1162 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  37.65 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  48.98 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  38.18 
 
 		 555 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  40.74 
 
 		 654 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  41.82 
 
 		 742 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>