32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00998 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  100 
 
 		 102 aa  213  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  53.92 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  57.84 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  57 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.94 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  53 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  48.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  52.48 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  50 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  49.02 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.12 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.18 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  46.08 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  40.82 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.82 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  41.05 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.2 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  43.24 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  42.7 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  40.96 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  40.54 
 
 		 648 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.31 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  34.67 
 
 		 674 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.31 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 1162 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 206 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  35.29 
 
 		 551 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  33.33 
 
 		 674 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  29.23 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  34.57 
 
 		 552 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>