41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1855 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 103 aa  215  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  49.5 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  48.04 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  50.5 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  48.51 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  49.02 
 
 		 102 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  46.39 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.57 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  47.52 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.72 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.58 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  43.56 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.16 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  40.59 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  45.56 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  43.56 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  38.61 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.58 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  38.71 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.54 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  41.1 
 
 		 793 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  34.88 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  36.49 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  38.96 
 
 		 715 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.73 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  33.71 
 
 		 648 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.58 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.58 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  31.91 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  28.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  28.57 
 
 		 674 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  28.57 
 
 		 674 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66529  regulation of G-protein function  39.22 
 
 		 468 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.29 
 
 		 732 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.29 
 
 		 735 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.67 
 
 		 731 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  29.17 
 
 		 426 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.82 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 1162 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>