37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1681 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  53.4 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  54.37 
 
 		 100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.04 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  48.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  49.02 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  42.16 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  43 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  43.88 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  40 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.58 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.42 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.38 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  38.24 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  40.23 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 		 1013 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.66 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.53 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  34 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.53 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  34.09 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.64 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  36.36 
 
 		 674 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  30.77 
 
 		 663 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  36.36 
 
 		 674 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.03 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 1162 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  33.77 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  36.11 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  28 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  36.76 
 
 		 648 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  40 
 
 		 555 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.56 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.06 
 
 		 900 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  26.32 
 
 		 93 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>