18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18260 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 900 aa  1826    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  39.19 
 
 		 715 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  40.24 
 
 		 555 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  33.33 
 
 		 663 aa  54.3  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1013 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  38.1 
 
 		 648 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  32.8 
 
 		 674 aa  50.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.81 
 
 		 1117 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  34.51 
 
 		 674 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  30.77 
 
 		 119 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  37.5 
 
 		 98 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.29 
 
 		 169 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  25.19 
 
 		 482 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.53 
 
 		 196 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 		 1162 aa  46.2  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18250  hypothetical protein  26.79 
 
 		 311 aa  45.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0286143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  28.79 
 
 		 990 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  42.37 
 
 		 2638 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>