31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4425 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 98 aa  206  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.9 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  41.3 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.17 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  43.84 
 
 		 648 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  39.74 
 
 		 674 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.74 
 
 		 674 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  42.31 
 
 		 426 aa  63.5  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 		 1013 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  38.96 
 
 		 663 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  41.56 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 1162 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0642  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.215543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  41.89 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  34.29 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 		 900 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  40.38 
 
 		 663 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  41.82 
 
 		 555 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.56 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.88 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.29 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.35 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  32.84 
 
 		 762 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.08 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.49 
 
 		 1117 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  34.72 
 
 		 715 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  38.24 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  42.31 
 
 		 793 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.54 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>