30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3886 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  46.49 
 
 		 119 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  39.78 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  45.07 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.81 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.81 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  42.05 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  42.05 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  42.17 
 
 		 648 aa  65.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 1162 aa  62.4  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3795  hypothetical protein  40.62 
 
 		 121 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3879  hypothetical protein  40.86 
 
 		 122 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0769157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  40.54 
 
 		 1013 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  37.88 
 
 		 560 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  38.75 
 
 		 98 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  27.93 
 
 		 110 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3738  hypothetical protein  40.86 
 
 		 121 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.515742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  32.18 
 
 		 98 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 958 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.33 
 
 		 900 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  34.95 
 
 		 715 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  34.21 
 
 		 555 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.88 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  28.46 
 
 		 401 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.33 
 
 		 650 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  31.58 
 
 		 102 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.17 
 
 		 97 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>