20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1569 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.67 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  32 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  41.76 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  35.63 
 
 		 663 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  41.1 
 
 		 674 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  41.1 
 
 		 674 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  31.51 
 
 		 648 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 		 1162 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2452  hypothetical protein  28.75 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 		 1013 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.03 
 
 		 97 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.89 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  32.61 
 
 		 555 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.11 
 
 		 169 aa  45.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  34.57 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  30.68 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>