27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1135 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 426 aa  844    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  44.81 
 
 		 674 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  44.81 
 
 		 674 aa  112  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  40.12 
 
 		 648 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  44.44 
 
 		 663 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 1162 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.86 
 
 		 131 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  42.31 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.08 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 		 1013 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  43.86 
 
 		 555 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  34.52 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  36.23 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 663 aa  46.6  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  37.14 
 
 		 84 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.48 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.92 
 
 		 98 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  36.49 
 
 		 100 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.66 
 
 		 1117 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.47 
 
 		 101 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  26.92 
 
 		 101 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  35.9 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.67 
 
 		 206 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.67 
 
 		 206 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.19 
 
 		 900 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  30.59 
 
 		 98 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 206 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>