43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2301 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 84 aa  175  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  56.47 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.28 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.56 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  48.28 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  43.02 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.08 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.08 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.23 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  43.75 
 
 		 663 aa  63.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  43.42 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  37.5 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  42.11 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.33 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.85 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  42.7 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  38.75 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  38.89 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 1162 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  31.76 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  39.24 
 
 		 648 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.96 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  33.73 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  34.29 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  38.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  38.27 
 
 		 674 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 1013 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  38.27 
 
 		 674 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  38.24 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.8 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.68 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.33 
 
 		 715 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  34.62 
 
 		 555 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  38 
 
 		 793 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  30.43 
 
 		 93 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.33 
 
 		 1117 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  37.14 
 
 		 426 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 		 400 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  29.89 
 
 		 223 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>