55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1180 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 648 aa  1296    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.58 
 
 		 674 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  39.73 
 
 		 674 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  52.49 
 
 		 663 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  53.78 
 
 		 1162 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  53.49 
 
 		 426 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.83 
 
 		 169 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52 
 
 		 206 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52 
 
 		 206 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  52.7 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 		 1013 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  43.42 
 
 		 119 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.51 
 
 		 97 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  43.84 
 
 		 98 aa  67.8  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  53.57 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.04 
 
 		 196 aa  67  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.68 
 
 		 1117 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  42.17 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  39.53 
 
 		 715 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  44.59 
 
 		 102 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  37.8 
 
 		 762 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  39.73 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.84 
 
 		 101 aa  55.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  40.22 
 
 		 102 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 102 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2520  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.32 
 
 		 248 aa  54.7  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000305079  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  37.35 
 
 		 101 aa  54.3  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.91 
 
 		 98 aa  53.9  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  39.24 
 
 		 84 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33884  predicted protein  37.33 
 
 		 272 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.025698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  31.51 
 
 		 209 aa  53.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  42.86 
 
 		 100 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  41.89 
 
 		 482 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  43.86 
 
 		 102 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.71 
 
 		 103 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.1 
 
 		 900 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  39.39 
 
 		 560 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.19 
 
 		 104 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  40.45 
 
 		 101 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0611  hypothetical protein  27.56 
 
 		 250 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  34.62 
 
 		 401 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  40.54 
 
 		 102 aa  47.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  40.3 
 
 		 109 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  34.62 
 
 		 375 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  24.15 
 
 		 1450 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  45 
 
 		 793 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1280  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.67 
 
 		 599 aa  46.6  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  36.14 
 
 		 98 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.85 
 
 		 102 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  30.85 
 
 		 110 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  36.76 
 
 		 102 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3879  hypothetical protein  31.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0769157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3795  hypothetical protein  31.65 
 
 		 121 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>