113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1533 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  48.84 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  41.23 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  32.78 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  35.04 
 
 		 648 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.68 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.68 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  31.87 
 
 		 674 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  31.87 
 
 		 674 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 1162 aa  57.8  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  40.26 
 
 		 1013 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  31.52 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.02 
 
 		 97 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  33.03 
 
 		 736 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.33 
 
 		 715 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  37.18 
 
 		 750 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  32.11 
 
 		 736 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  38.36 
 
 		 737 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  45.65 
 
 		 648 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  38.67 
 
 		 733 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  39.73 
 
 		 736 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.98 
 
 		 741 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  36.73 
 
 		 645 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  33.75 
 
 		 426 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  34.88 
 
 		 98 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 728 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 728 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 728 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 728 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 728 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.99 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35 
 
 		 631 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  36.99 
 
 		 764 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  34.57 
 
 		 749 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  44.19 
 
 		 726 aa  45.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  42.22 
 
 		 725 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.51 
 
 		 900 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 400 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  34.38 
 
 		 680 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  37.5 
 
 		 728 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  42.22 
 
 		 732 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.18 
 
 		 731 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  42.22 
 
 		 732 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.57 
 
 		 638 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.51 
 
 		 630 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  34.62 
 
 		 732 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.84 
 
 		 646 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  34.15 
 
 		 728 aa  44.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  42.22 
 
 		 731 aa  44.7  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 834 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  34.67 
 
 		 642 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  34.15 
 
 		 728 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  42.55 
 
 		 728 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.45 
 
 		 721 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  30.28 
 
 		 741 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.35 
 
 		 623 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  37.29 
 
 		 741 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  31.25 
 
 		 728 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.91 
 
 		 728 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 764 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  38.78 
 
 		 743 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  39.58 
 
 		 626 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  32.89 
 
 		 736 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1158  glycoside hydrolase family 13 protein  40 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  35.62 
 
 		 735 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 740 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.84 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.84 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  40 
 
 		 743 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  40 
 
 		 743 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  40 
 
 		 743 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 730 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  40 
 
 		 743 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 743 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  35.53 
 
 		 555 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  47.37 
 
 		 652 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  30.67 
 
 		 712 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  37.18 
 
 		 716 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.51 
 
 		 639 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  44.44 
 
 		 716 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  38.36 
 
 		 731 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.5 
 
 		 678 aa  42  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  35.62 
 
 		 727 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.45 
 
 		 1117 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.73 
 
 		 721 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 712 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.43 
 
 		 732 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  37.78 
 
 		 774 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  42.22 
 
 		 746 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  38.64 
 
 		 727 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  38.64 
 
 		 727 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>