More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0981 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 652 aa  1341    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  55.92 
 
 		 768 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  55.92 
 
 		 768 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  54.38 
 
 		 722 aa  622  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  53.96 
 
 		 775 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  52.38 
 
 		 737 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  53.1 
 
 		 736 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.21 
 
 		 725 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  52.18 
 
 		 725 aa  608  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  53.21 
 
 		 733 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  54.3 
 
 		 727 aa  608  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.32 
 
 		 726 aa  611  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  53.1 
 
 		 736 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  53.67 
 
 		 625 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  50.65 
 
 		 735 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  50.62 
 
 		 677 aa  611  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  52.05 
 
 		 736 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.26 
 
 		 741 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  52.78 
 
 		 677 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  52.94 
 
 		 736 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.99 
 
 		 728 aa  608  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  50.73 
 
 		 729 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  52.55 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  53.87 
 
 		 728 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  52.92 
 
 		 736 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  53.69 
 
 		 695 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  51.89 
 
 		 728 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  51.55 
 
 		 740 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  51.78 
 
 		 725 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  53.38 
 
 		 728 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.41 
 
 		 629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  53.52 
 
 		 732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  53.27 
 
 		 727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.44 
 
 		 726 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.47 
 
 		 736 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.8 
 
 		 1217 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  50.82 
 
 		 749 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  53.38 
 
 		 728 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  52.95 
 
 		 632 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  53.03 
 
 		 732 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  53.01 
 
 		 741 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  53.23 
 
 		 750 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.21 
 
 		 732 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  51.82 
 
 		 736 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.98 
 
 		 740 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  50.99 
 
 		 723 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.33 
 
 		 728 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.64 
 
 		 784 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.02 
 
 		 729 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  50.95 
 
 		 728 aa  595  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 639 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  51.13 
 
 		 728 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.64 
 
 		 784 aa  591  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  53.34 
 
 		 727 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  53.34 
 
 		 727 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  51.79 
 
 		 743 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  51.19 
 
 		 736 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.31 
 
 		 785 aa  591  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.22 
 
 		 732 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  52.07 
 
 		 732 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  52.14 
 
 		 712 aa  586  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.23 
 
 		 723 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 721 aa  586  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.47 
 
 		 770 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.51 
 
 		 737 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  50.49 
 
 		 728 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 		 725 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  53.34 
 
 		 727 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  51.64 
 
 		 748 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.28 
 
 		 621 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  52.29 
 
 		 812 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.63 
 
 		 747 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 732 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 749 aa  585  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  50.99 
 
 		 716 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  51.31 
 
 		 727 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  50.47 
 
 		 733 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.06 
 
 		 742 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  50.66 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.81 
 
 		 768 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  50.55 
 
 		 736 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.75 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  49.92 
 
 		 748 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 735 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  50.65 
 
 		 728 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.9 
 
 		 743 aa  581  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  51.48 
 
 		 716 aa  581  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  50.81 
 
 		 728 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.66 
 
 		 760 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  50.81 
 
 		 728 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.33 
 
 		 730 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  49.51 
 
 		 785 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.66 
 
 		 633 aa  582  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  50.81 
 
 		 728 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 1240 aa  578  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 732 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  50.65 
 
 		 728 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  50.24 
 
 		 736 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 957 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 733 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>