259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0535 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  93.85 
 
 		 738 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  93.85 
 
 		 738 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  93.46 
 
 		 738 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  70.9 
 
 		 733 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  68.77 
 
 		 733 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  65.07 
 
 		 736 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  64.71 
 
 		 736 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  64.71 
 
 		 736 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  63.84 
 
 		 732 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  61.25 
 
 		 735 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  55.43 
 
 		 741 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  55.95 
 
 		 736 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  57.61 
 
 		 736 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  54.67 
 
 		 712 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.46 
 
 		 741 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 732 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  47.66 
 
 		 735 aa  211  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  49.8 
 
 		 737 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 741 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  49.8 
 
 		 768 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  49.8 
 
 		 768 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  52.89 
 
 		 732 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  49.02 
 
 		 736 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 743 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  51.03 
 
 		 727 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 733 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  49.37 
 
 		 736 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  49.79 
 
 		 736 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  49.79 
 
 		 736 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  49.37 
 
 		 736 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  51.54 
 
 		 775 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 750 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  48.1 
 
 		 722 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48 
 
 		 732 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 728 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  44.09 
 
 		 735 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  43.87 
 
 		 735 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.07 
 
 		 785 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.64 
 
 		 728 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.81 
 
 		 742 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.49 
 
 		 768 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.8 
 
 		 784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.96 
 
 		 721 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.8 
 
 		 784 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.98 
 
 		 729 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.63 
 
 		 807 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  37.3 
 
 		 729 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  45.09 
 
 		 727 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  50.42 
 
 		 834 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.33 
 
 		 737 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.64 
 
 		 760 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  46.26 
 
 		 716 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.49 
 
 		 770 aa  168  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  42.8 
 
 		 728 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  44.14 
 
 		 727 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  42.39 
 
 		 728 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  45.91 
 
 		 712 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  43.12 
 
 		 725 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  43.24 
 
 		 727 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  42.79 
 
 		 727 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  42.66 
 
 		 725 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.8 
 
 		 721 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  42.79 
 
 		 727 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  46.08 
 
 		 716 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  42.79 
 
 		 728 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  46.36 
 
 		 716 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  43.4 
 
 		 738 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  45.33 
 
 		 716 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  41.31 
 
 		 749 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  42.13 
 
 		 725 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03237  hypothetical protein  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0399493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  42.34 
 
 		 728 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  45.45 
 
 		 716 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  45.41 
 
 		 716 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.23 
 
 		 739 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.08 
 
 		 735 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.08 
 
 		 732 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  41.25 
 
 		 740 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.44 
 
 		 723 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  38.37 
 
 		 745 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.17 
 
 		 730 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  38.37 
 
 		 745 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  37.98 
 
 		 743 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  43.69 
 
 		 728 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  37.98 
 
 		 743 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  43.72 
 
 		 721 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>