132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3736 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
206 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  92.72 
 
 
206 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  92.72 
 
 
206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  52.7 
 
 
648 aa  81.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  46.67 
 
 
674 aa  78.6  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  51.14 
 
 
119 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  46.67 
 
 
674 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  46.75 
 
 
663 aa  74.7  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  39.38 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 
1162 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.42 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  41.3 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  41.98 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.78 
 
 
101 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.71 
 
 
169 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 
1013 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  38.36 
 
 
102 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.96 
 
 
131 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  33.71 
 
 
102 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  41.25 
 
 
727 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  46.43 
 
 
555 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  33.8 
 
 
84 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  50.91 
 
 
750 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  36.99 
 
 
100 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 
400 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  41.18 
 
 
793 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  40.24 
 
 
209 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.94 
 
 
741 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.29 
 
 
1117 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.23 
 
 
822 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.18 
 
 
731 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
102 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.98 
 
 
754 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  34.88 
 
 
715 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.72 
 
 
97 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.86 
 
 
741 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.89 
 
 
990 aa  48.5  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  49.06 
 
 
741 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  36.21 
 
 
729 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  30.59 
 
 
98 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  40.74 
 
 
732 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  43.48 
 
 
748 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.48 
 
 
726 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  36.08 
 
 
749 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33884  predicted protein  35.14 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.025698  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  26.51 
 
 
101 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  39.25 
 
 
369 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  43.84 
 
 
737 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  45.21 
 
 
736 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  44 
 
 
764 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.29 
 
 
743 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  34.35 
 
 
732 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  43.48 
 
 
785 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  50 
 
 
738 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1393  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 
1016 aa  45.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 
743 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0981  glycogen branching enzyme  44.83 
 
 
652 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.37129  normal  0.433168 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 
282 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 
282 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  50 
 
 
738 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  50 
 
 
738 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  39.22 
 
 
736 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  45.28 
 
 
725 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 
733 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  49.06 
 
 
736 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  44.44 
 
 
736 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  44.44 
 
 
736 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.73 
 
 
103 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.29 
 
 
104 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.1 
 
 
731 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  32.47 
 
 
101 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  44.44 
 
 
735 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  37.5 
 
 
654 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  36.36 
 
 
749 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.33 
 
 
839 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  43.64 
 
 
721 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  40 
 
 
776 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  36.49 
 
 
723 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  49.02 
 
 
712 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.14 
 
 
732 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  39.39 
 
 
728 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.48 
 
 
736 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  41.67 
 
 
743 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38 
 
 
654 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.58 
 
 
102 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.54 
 
 
98 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.17 
 
 
659 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 
732 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.15 
 
 
760 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  43.06 
 
 
736 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 
741 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.78 
 
 
678 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.23 
 
 
630 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.6 
 
 
900 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  44.44 
 
 
735 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  44 
 
 
763 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  45.71 
 
 
732 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  45 
 
 
755 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  38.67 
 
 
426 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 
732 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>