55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3888 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.23 
 
 		 196 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  51.14 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  43.9 
 
 		 663 aa  79.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  51.14 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 		 1162 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  41.76 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.5 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.5 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  39.29 
 
 		 674 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.29 
 
 		 674 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  43.42 
 
 		 648 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  45.95 
 
 		 555 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  41.56 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  41.1 
 
 		 1013 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.02 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  37.33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  34.09 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  35.29 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.99 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  33.73 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.71 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  36.23 
 
 		 426 aa  47.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  30.23 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.58 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  34.88 
 
 		 560 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.38 
 
 		 900 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.92 
 
 		 1117 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.38 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  37.65 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 400 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.61 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  31.63 
 
 		 715 aa  43.5  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  24.71 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  43.84 
 
 		 728 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 695 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  31.43 
 
 		 762 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  29.82 
 
 		 102 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33884  predicted protein  31.08 
 
 		 272 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.025698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2452  hypothetical protein  28 
 
 		 226 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  42.67 
 
 		 738 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  42.67 
 
 		 738 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  42.67 
 
 		 738 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.17 
 
 		 741 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.67 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.67 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.21 
 
 		 650 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  38.55 
 
 		 736 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.71 
 
 		 674 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  35 
 
 		 645 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  27.91 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  39.47 
 
 		 736 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  31.11 
 
 		 482 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>