41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5813 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  202  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  66.99 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  57 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  54.37 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  52 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  51.96 
 
 		 102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  50.98 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  45 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  51 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.52 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.08 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.99 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  41.18 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  40.21 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  48.57 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  38.78 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.73 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  41.33 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.08 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  43.59 
 
 		 674 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  42.31 
 
 		 674 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  37.33 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  42.86 
 
 		 648 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 206 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  35.53 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  51.02 
 
 		 793 aa  51.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 1162 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  38.82 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  32.81 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.03 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.51 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.51 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  36 
 
 		 426 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  40.74 
 
 		 555 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.8 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  33.93 
 
 		 715 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58903  Glucose repression protein GAL83 (SPM1 protein)  33.78 
 
 		 249 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0305354  normal  0.109445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 400 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  37.5 
 
 		 663 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>