21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3124 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  100 
 
 		 93 aa  193  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  51.09 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  50.56 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  44.74 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.56 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.88 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.12 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  35.8 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  37.65 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  35.06 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  38.82 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  33.77 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.8 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  34.67 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.35 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  39.74 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.46 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  30.43 
 
 		 84 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  33.33 
 
 		 648 aa  41.6  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 400 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>