26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0280 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  50.56 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  54.35 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.68 
 
 		 97 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  47.69 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.19 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  43.24 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41.33 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  35.29 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 400 aa  52.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  38.03 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.73 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.58 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  38.03 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.73 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.36 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.25 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  37.68 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  30.49 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  34.25 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  31.08 
 
 		 648 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  35.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  30.56 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 1162 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>