34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1368 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  59.62 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  57.69 
 
 
102 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  47.12 
 
 
102 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.08 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  44.23 
 
 
102 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  42.72 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  41.18 
 
 
101 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  46.08 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 
102 aa  87  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  39.42 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  45.63 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  32.69 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.56 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  38.96 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  33.66 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  31.17 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  42.19 
 
 
648 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  43.86 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  37.35 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  39.06 
 
 
674 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  34.38 
 
 
109 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.06 
 
 
674 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  36.05 
 
 
663 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  39.58 
 
 
793 aa  45.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.1 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.29 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.36 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  45.45 
 
 
654 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 
400 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>