49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0960 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  99.26 
 
 		 674 aa  1331    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 674 aa  1338    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  40 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  56.2 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  59.83 
 
 		 1162 aa  270  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  44.08 
 
 		 426 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.91 
 
 		 169 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 206 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.95 
 
 		 206 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.95 
 
 		 206 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  41.51 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  39.29 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.53 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  42.05 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  39.74 
 
 		 98 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 		 1013 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.44 
 
 		 97 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.58 
 
 		 102 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.87 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 400 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  42.86 
 
 		 102 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.34 
 
 		 101 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  43.59 
 
 		 100 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  41.1 
 
 		 209 aa  55.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  38.89 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.45 
 
 		 1117 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  39.02 
 
 		 663 aa  55.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  40.91 
 
 		 101 aa  54.3  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  38.16 
 
 		 102 aa  53.9  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  40.32 
 
 		 102 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.82 
 
 		 900 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.82 
 
 		 102 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  36.36 
 
 		 102 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0642  hypothetical protein  35.37 
 
 		 234 aa  50.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.215543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.03 
 
 		 98 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  38.27 
 
 		 84 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  34.15 
 
 		 101 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  42.03 
 
 		 560 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 543 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1280  1,4-alpha-glucan branching enzyme  21.57 
 
 		 599 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  34.12 
 
 		 98 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  34.18 
 
 		 482 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  39.06 
 
 		 104 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  33.72 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  42.62 
 
 		 793 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06570  Snf1 kinase complex beta-subunit Gal83, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04500)  38.89 
 
 		 459 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000201401  normal  0.0752619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 552 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3879  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0769157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3795  hypothetical protein  29.7 
 
 		 121 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>