170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0803 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1162 aa  2352    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  32.23 
 
 		 1042 aa  458  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  50.12 
 
 		 663 aa  416  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  36.19 
 
 		 829 aa  354  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  31.19 
 
 		 749 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  31.19 
 
 		 749 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  30.85 
 
 		 744 aa  348  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 744 aa  344  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  31.18 
 
 		 747 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  34.97 
 
 		 729 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 731 aa  323  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  35.24 
 
 		 729 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  33.28 
 
 		 732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  33.92 
 
 		 728 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 		 734 aa  320  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  34.9 
 
 		 728 aa  318  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  29.67 
 
 		 743 aa  312  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 726 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  36.42 
 
 		 674 aa  300  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  27.49 
 
 		 726 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  27.26 
 
 		 726 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  32.52 
 
 		 722 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  33.02 
 
 		 695 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 		 1006 aa  284  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  60.33 
 
 		 674 aa  280  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  59.92 
 
 		 674 aa  280  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 		 759 aa  277  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  31.27 
 
 		 1000 aa  274  7e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  28.19 
 
 		 577 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 582 aa  268  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 994 aa  266  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 580 aa  264  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  31.8 
 
 		 566 aa  263  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 1022 aa  259  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  52.05 
 
 		 648 aa  247  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 566 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 570 aa  243  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  28.5 
 
 		 580 aa  243  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  29 
 
 		 574 aa  240  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  29.49 
 
 		 568 aa  240  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  29.49 
 
 		 568 aa  240  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 551 aa  238  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 575 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  33.05 
 
 		 313 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  28.43 
 
 		 902 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  50.51 
 
 		 426 aa  97.8  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  32.75 
 
 		 267 aa  97.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 1187 aa  95.1  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  31.38 
 
 		 609 aa  94  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.28 
 
 		 169 aa  87.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  29.33 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  28.36 
 
 		 273 aa  81.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  30.7 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  28.62 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  26.11 
 
 		 1255 aa  75.1  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  28.42 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  27.66 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  43.06 
 
 		 119 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 471 aa  73.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 813 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  22.22 
 
 		 794 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 206 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  26.32 
 
 		 267 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  26.53 
 
 		 267 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  44.16 
 
 		 206 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  44.16 
 
 		 206 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 606 aa  70.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  26.02 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  26.79 
 
 		 823 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 472 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 1013 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  25.21 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  23.85 
 
 		 812 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 816 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 871 aa  62.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  38.64 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  23.43 
 
 		 812 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  38.37 
 
 		 555 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 394 aa  60.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  28.95 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  28.74 
 
 		 766 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.59 
 
 		 196 aa  57.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 811 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 838 aa  57.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.94 
 
 		 97 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  29.37 
 
 		 715 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  23.86 
 
 		 518 aa  57  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 400 aa  57.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16000  hypothetical protein  21.68 
 
 		 542 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33 
 
 		 1117 aa  57.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  25 
 
 		 814 aa  56.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  29.86 
 
 		 527 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>