39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6053 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  48.85 
 
 		 1013 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  48.35 
 
 		 648 aa  88.6  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  48.28 
 
 		 1162 aa  87.4  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  48.91 
 
 		 674 aa  81.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  48.91 
 
 		 674 aa  80.9  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  47.13 
 
 		 663 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  40 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  40 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  37.08 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  36.36 
 
 		 555 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  35.29 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  36.99 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  42.03 
 
 		 102 aa  50.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_19706  predicted protein  31.25 
 
 		 482 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.126767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  34.09 
 
 		 715 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.62 
 
 		 97 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33884  predicted protein  32.86 
 
 		 272 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.025698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  35.8 
 
 		 84 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.7 
 
 		 1117 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.44 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.29 
 
 		 900 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  30.56 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  35.38 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.67 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  44.78 
 
 		 1401 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  37.68 
 
 		 1307 aa  44.7  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 663 aa  44.3  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1393  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 1016 aa  44.3  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.62 
 
 		 1331 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  33.7 
 
 		 2638 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  50 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  33.33 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.91 
 
 		 100 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  34.04 
 
 		 1643 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  46 
 
 		 560 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 		 400 aa  41.2  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.82 
 
 		 103 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>